Veden hapettaminen on erittäin tärkeää melkein kaikissa vesiviljelyjärjestelmissä. Veden hapetus tapahtuu yleensä ilmakiven ja ilmapumpun avulla, mutta muitakin vaihtoehtoja on olemassa.

Runsas happi juurten ympärillä estää haitallisten taudinaiheuttajien syntymistä juuristoon ja siten ehkäisee kasvin sairastumista. Lisäksi hapekas ympäristö edistää kasvin kykyä imeä ravinteita ja jopa vettä, joten happipitoisuus on suoraan yhteydessä kasvin kasvupotentiaaliin.